近期，《Frontiers in Genetics》雜志（IF:4.15）刊登了一篇針對罕見神經發育障礙疾�。∟eurodevelopmental disorders，NDDs）的分子診斷策略的研究。該研究對54例NDDs患者應用一種聯合家系全外顯子測序（trioWES）和家系低深度全基因組拷貝數變異測序（trioCNVseq）的檢測策略（以下簡稱“全外聯合CNVseq家系”），對致病變異的檢出率可達57.4%(31/54)，其中trioWES檢出率44.4% (24/54),trioCNVseq檢出率達到14.8%(8/54)，約為trio-WES檢出率的三分之一。本研究是基于北京智因東方（Chigene）公司的技術平臺完成的。

      NDDs是一類有著高度的遺傳異質性和表型異質性的疾病，與其相關的致病性基因變異有多種形式，包括大型變異（>100kb以上的CNV）、中型變異（基因內部的外顯子缺失或重復）、小型變異（點突變或小的插入缺失）等。全外聯合CNVseq檢測策略可以囊括大中小多種變異形式，故與trioWES策略相比，能進一步顯著提升這類疾病的檢出率。

      另外，NDDs的遺傳背景存在復雜性，有的患者可能一個人同時存在兩種致病基因變異，本研究中就發現一例患者為點突變（借助trioWES檢出）和CNV（借助CNVseq檢出）均為陽性的案例，即在同一個患者身上同時呈現兩種不同形式的致病變異導致的混合表型。對于這種情況，孤立的檢測策略，如僅檢測trioWES，或僅檢測CNVseq（或CMA），即便檢出致病變異，仍無法確定該變異是否是全部致病原因，還是協同原因，亦或是無關的發現，仍有可能導致片面的診斷結果，而全外聯合CNVseq家系檢測策略所檢測的范圍和變異形式更為全面，有可能揭示一個患者同時存在這兩類變異的情況，故有助于解決上述難題。

      關于智因東方

      智因東方（原德易東方）是基因大數據診斷技術的領先企業，基于十年的行業積淀，構建了全球最大的中國人遺傳病基因-表型數據庫，參與發表了數十篇學術論文，并開創了多個行業第一：

      1) 2009年業內第一家建立線粒體、溶酶體酶活性檢測方法。

      2) 2011年，智因東方建立業內首家一代測序方法診斷四千種病的技術平臺。

      3) 2013年，業內最先設計并推出一次診斷人類全部四千多種單基因病項目，這個項目后來在2015年在美國開始興起，叫做臨床外顯子組（Clinical Exome）。

      4) 2013年，業內最先提出 “生物+遺傳+臨床特征”的三要素邏輯，為實現“百萬挑一、大海撈針”的精準診斷提供了可能。

      5) 2013年，智因東方在業內最先將變異的致病性分成“致病、可能致病、不確定、可能不致病、不致病”這五級來管理，該理念在兩年后成為美國ACMG變異致病評級原則的一部分。

      6) 2015年初，業內率先推行家系TrioWES檢測模式的公司，而今家系TrioWES用于遺傳病診斷已幾乎成為國際遺傳學界的共識和常識。

      7) 2015年業內首家推出面向醫生的遺傳病基因數據分析平臺——全譜®遺傳病精準診斷云平臺。這個平臺的出現，使得醫生、遺傳專家互動參與檢測分析過程稱為可能。利用這個平臺，用戶可以方便快捷的管理患者的臨床表型，并且有可能“分分鐘”搞掂基因數據分析。

      8) 2016年業內首家推出遺傳病診斷高陽性率整體解決方案——trio（WES+CNVseq），即全外聯合CNVseq家系檢測策略，可將陽性率理論值從15%提升至50~70% 。

      9) 2017年推出業內首家基于基因-表型大數據的精準診斷體系，實現大數據表型聚類分析。

      10) 2017年業內首家推出基于WES的外顯子CNV分析算法，實現NGS全面檢測大中小三類變異。

      11) 2018年推出業內首家遺傳病極速診斷模式，在保證相對經濟性的前提下，將過去需要數月的NGS檢測分析周期，縮短到6~10天。

      智因東方（原德易東方）將持續推動遺傳病精準診斷的技術創新，提供高效便捷的精準診斷技術工具和服務。

      文章原文：

      (2019) Diagnostic Yields of Trio-WES Accompanied by CNVseq for Rare Neurodevelopmental Disorders. Front. Genet. 10:485. doi: 10.3389/fgene.2019.00485